Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acta1P68134 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta1P68134 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms