Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Megf8P60882 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Megf8P60882 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms