Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hps5P59438 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hps5P59438 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms