Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms