Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnfP51944 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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