Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpdP50404 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms