Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ItgavP43406 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ItgavP43406 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ItgavP43406 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ItgavP43406 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms