Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpl28P41105 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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