Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms