Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms