Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SsbP32067 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SsbP32067 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SsbP32067 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SsbP32067 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SsbP32067 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SsbP32067 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SsbP32067 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SsbP32067 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms