Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms