Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa5P28312 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms