Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChgaP26339 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms