Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms