Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk11bP24788 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms