Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RarbP22605 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RarbP22605 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RarbP22605 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RarbP22605 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms