Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3P21107 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms