Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VimP20152 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VimP20152 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VimP20152 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms