Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms