Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RhoP15409 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RhoP15409 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RhoP15409 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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