Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vpreb1P13372 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms