Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FosbP13346 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FosbP13346 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FosbP13346 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FosbP13346 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FosbP13346 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FosbP13346 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FosbP13346 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FosbP13346 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms