Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PolP10400 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PolP10400 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PolP10400 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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