Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl1P10146 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms