Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms