Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms