Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TnfP06804 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TnfP06804 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnfP06804 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnfP06804 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnfP06804 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnfP06804 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms