Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfrbP05622 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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