Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01810 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01810 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01810 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01810 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01810 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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P01810 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01810 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01810 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01810 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01810 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01810 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01810 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01810 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01810 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01810 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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