Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01740 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01740 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01740 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01740 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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