Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnnt1O88346 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnnt1O88346 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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