Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FxnO35943 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FxnO35943 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FxnO35943 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FxnO35943 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FxnO35943 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FxnO35943 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FxnO35943 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FxnO35943 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FxnO35943 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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FxnO35943 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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