Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Klf9O35739 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Klf9O35739 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Klf9O35739 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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