Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clk2O35491 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clk2O35491 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clk2O35491 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clk2O35491 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clk2O35491 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clk2O35491 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clk2O35491 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk2O35491 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms