Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Eftud2O08810 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms