Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MttpO08601 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MttpO08601 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MttpO08601 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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MttpO08601 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MttpO08601 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MttpO08601 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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MttpO08601 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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MttpO08601 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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MttpO08601 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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MttpO08601 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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MttpO08601 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MttpO08601 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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