Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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