Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms