Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h12bG3X9I7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h12bG3X9I7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h12bG3X9I7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h12bG3X9I7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h12bG3X9I7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms