Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm28038F7BCN9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms