Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8247F6VRJ8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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