Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pdzd2E9Q1M1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pdzd2E9Q1M1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pdzd2E9Q1M1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pdzd2E9Q1M1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pdzd2E9Q1M1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzd2E9Q1M1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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