Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fndc1E9Q043 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fndc1E9Q043 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms