Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms