Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scaf11E9PZM7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scaf11E9PZM7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms