Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde2E9PUP1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms