Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd1D3YXK1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms