Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm17333C6EQI3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm17333C6EQI3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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