Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Abcc8B2RUS7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms